Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms