Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms