Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms