Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms