Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms