Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKOR1P84550 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms