Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PROK1P58294 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PROK1P58294 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms