Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSCP56915 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSCP56915 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSCP56915 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.3 ms