Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB1P54762 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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