Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms