Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms