Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC4A3P48751 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC4A3P48751 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms