Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCLMP48507 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms