Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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