Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms