Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK1P29120 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms