Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms