Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBTFP17480 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBTFP17480 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBTFP17480 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBTFP17480 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms