Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNT1P13805 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNT1P13805 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms