Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODC1P11926 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODC1P11926 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms