Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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