Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PYGBP11216 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms