Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRFP10586 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms