Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGAVP06756 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms