Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PF4P02776 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PF4P02776 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PF4P02776 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PF4P02776 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PF4P02776 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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