Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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