Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCATO75600 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCATO75600 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCATO75600 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms