Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTNBO60941 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms