Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DENRO43583 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DENRO43583 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms