Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XRCC2O43543 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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