Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COCHO43405 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COCHO43405 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms