Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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