Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCAO15360 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCAO15360 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FANCAO15360 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FANCAO15360 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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