Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MUSKO15146 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MUSKO15146 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MUSKO15146 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUSKO15146 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms