Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms