Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HHLA1C9JL84 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms