Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms