Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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