Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3CA6NKF2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms