Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XIRP2A4UGR9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms