Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms