Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms