Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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