Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms