Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms