Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF8Q9UPP1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms