Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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