Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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