Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms