Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM8A1Q9UBU6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms